Во времена MBR ставил сперва форточки, при этом разбивая диск на 4 директории - две маленькие под загрузчик винды и загрузчик Пингвина, две большие - под винду и Linux. Затем ставил Пингвина и он прописывал в свой Grub при установке запись MBR винды.
Далее при загрузке Grub ставил окошко с вопросом что грузить и всё.